香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。
　　由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。

　　裁判法院法官高希敏（宣萱 饰）是个出名的钉官，铁脸无私，公正严明。潜意识里希敏不相信男人，也不相信婚姻！却想不到一次意外的邂逅，她竟然闪电结婚！令她改变初衷的，不是高大威猛的事业型男人，却是个喜欢打理家头细务凑仔煮饭的小男人葛国光（陈锦鸿 饰）。原因竟是因为一次酒后缠绵，却发现希敏怀了自己的骨肉，并打算堕胎，国光竭力阻止，并向希敏求婚，被一口拒绝。希敏为了断绝国光的纠缠，故意订立了一份非常苛刻的婚前协议书，以为用这方法可以吓走国光，想不到国光竟然毫不犹豫，立即签署！并立誓遵守协议书所有条文，令希敏大为感动，终于答应与国光结婚，并生下小儿子，开始了三小口子的幸福家庭。然而始终磨难不断。

　　钟立文（吴卓羲 饰）和韦柏翘（陈键峰 饰）同期考入警校，二人一个性格冲动一个固执，不可能成为朋友的二人因为都对教官李文升（苗桥伟 饰）反感而站在统一阵线。文升对学员要求严格，学员怨声载天。然而随着大家的进步，渐渐明白文升是为自己好。立文遇上女贼阿花，对她产生好感，阿花全家做贼，虽然自己认为这是不对的也仍然难以启齿。柏翘与同学fiona（薛凯琪 饰）互生情愫，而fiona家境优渥，柏翘的自尊心让二人关系忽冷忽热。这时柏翘发现文升原来是自己的亲生父亲，就是二十年前抛弃自己母子的人，打击甚大。
　　这些年轻人都要承受生活的考验，才能在警校和人生的道路上，顺利毕业。

　　楚国大将军荆烈（唐文龙饰）与术士单无邪（陈豪饰）是师兄弟，因妻子雪姬（梁铮饰）与无邪偷情而掀起了一场情杀。无邪死；荆烈的魂魄化作一团怨气；雪姬的魂魄则长埋一陶俑内。
　　荆烈飘泊于天地间凡千多年，至明太祖朱元璋鄱阳湖一役而得以吸取无数怨气，成为邪灵之王。申十郎（关德辉饰）出生时祥云飘降， 家人认定他非池中物。十郎生来愚钝，原来上天选定他作为对付荆烈之人选，叫他七窍不开乃让他不受邪魔所侵。多年后，荆烈夜观天象，发现一股与自己抗衡的力量，决定探过究竟。荆烈来到十郎家，发现十郎母水芙蓉（苏玉华饰）是昔日曾与己有一夕情缘的仙子。荆烈逼芙蓉相见但遭拒绝，一怒之下斩杀十郎全家；芙蓉自刎，临终时为保十郎安危而骗荆烈十郎为其亲子。
　　十郎其后得天池神水之助得以渐渐开窍，发现自己前世竟然是无邪！荆烈得知十郎是其前世宿怨，怨气更盛；十郎虽有金身护体，仍不敌荆烈，元神飞走，七日内不归位便会灰飞烟灭……

　　香港飞行服务队(GFS)二级空勤主任高可风(郑伊健饰)和一级机师叶青云(林保怡饰)一个负责拯救一个负责驾驶，合作默契。可风的女友康友岚（佘诗曼饰）三年前因车祸昏迷，至今未醒。可风每天都去医院探望，终于奇迹发生，友岚苏醒过来，但是失去所有记忆。在可风的热情下重新接受他。叶青云与妻子离婚多年，独自带着可爱的儿子Jacket生活，感觉不到房东兼同事小娟对他的爱意。GFS新一届的学员诞生，风、云分别担任施楚淇（钟嘉欣饰）与见习机师蒋加诺（黎诺懿饰）的导师，淇自小被父亲抛弃，在孤儿院长大，自卑感严重；而加诺是富家少爷，但家庭突遭巨变。面对种种压力，他们能否顺利毕业？而友岚感觉被热心助人的可风冷落，感情渐渐偏向叶青云，突然的恢复记忆让她忆起了当日车祸的真相。他们的感情线将何去何从？

　　鸭寮街是香港的缩影，随着香港经济起落，它亦经历过由欣欣向荣的黄金年代，沦为二手货交易市场的命运。
　　金融风暴前，戴少良的高级音响专门店是鸭寮街内最大的一家，其好友成大志因投机坐拥过千万的身家；金融风暴后，少良生意大不如前，大志亦沦为负资产。唯独二人好友关炳仁脚踏实地，不受影响。三人虽背景回异，但交情甚笃，热爱足球，三人组成的球队，在区内更被冠以「鸭记风尘三侠」的称号。
　　国际名导演卫家明女友卓琳为电影美指，为电影到鸭寮街搜集资料。她遇上少良，发现他一直怀缅过去的原因，原来少良七年前曾与歌影红星卓宁有一段七日情缘。自此，少良认定那段时期是他人生最风光的时刻，事业、爱情皆得意。虽事隔多年，并未与时并进。